Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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