Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gtf3c1Q8K284 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gtf3c1Q8K284 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gtf3c1Q8K284 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gtf3c1Q8K284 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gtf3c1Q8K284 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gtf3c1Q8K284 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gtf3c1Q8K284 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gtf3c1Q8K284 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gtf3c1Q8K284 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gtf3c1Q8K284 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gtf3c1Q8K284 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gtf3c1Q8K284 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gtf3c1Q8K284 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c1Q8K284 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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