Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms