Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Cldn34c1Q8K193 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Cldn34c1Q8K193 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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