Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Znf628Q8CJ78 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Znf628Q8CJ78 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Znf628Q8CJ78 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Znf628Q8CJ78 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Znf628Q8CJ78 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Znf628Q8CJ78 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Znf628Q8CJ78 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Znf628Q8CJ78 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms