Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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SbsnQ8CIT9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms