Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Csnka2ipQ8CH19 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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