Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usp20Q8C6M1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usp20Q8C6M1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp20Q8C6M1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp20Q8C6M1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp20Q8C6M1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp20Q8C6M1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp20Q8C6M1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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