Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms