Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Tnfsfm13Q8BXS2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Tnfsfm13Q8BXS2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Tnfsfm13Q8BXS2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Tnfsfm13Q8BXS2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsfm13Q8BXS2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsfm13Q8BXS2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsfm13Q8BXS2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsfm13Q8BXS2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsfm13Q8BXS2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Tnfsfm13Q8BXS2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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