Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ube3dQ8BX13 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ube3dQ8BX13 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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