Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ctdsp2Q8BX07 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ctdsp2Q8BX07 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ctdsp2Q8BX07 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ctdsp2Q8BX07 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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