Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf187Q8BFX1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf187Q8BFX1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf187Q8BFX1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf187Q8BFX1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf187Q8BFX1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf187Q8BFX1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf187Q8BFX1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf187Q8BFX1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnf187Q8BFX1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnf187Q8BFX1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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