Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms