Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms