Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms