Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms