Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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