Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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