Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms