Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup98Q6PFD9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup98Q6PFD9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup98Q6PFD9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup98Q6PFD9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup98Q6PFD9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup98Q6PFD9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup98Q6PFD9 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup98Q6PFD9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup98Q6PFD9 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup98Q6PFD9 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup98Q6PFD9 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup98Q6PFD9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup98Q6PFD9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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