Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms