Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
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NipblQ6KCD5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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