Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt77Q6IFZ6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt77Q6IFZ6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt77Q6IFZ6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt77Q6IFZ6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt77Q6IFZ6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt77Q6IFZ6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt77Q6IFZ6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Krt77Q6IFZ6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt77Q6IFZ6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt77Q6IFZ6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt77Q6IFZ6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Krt77Q6IFZ6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt77Q6IFZ6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt77Q6IFZ6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt77Q6IFZ6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Krt77Q6IFZ6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Krt77Q6IFZ6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Krt77Q6IFZ6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Krt77Q6IFZ6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Krt77Q6IFZ6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Krt77Q6IFZ6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Krt77Q6IFZ6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt77Q6IFZ6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms