Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nop58Q6DFW4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nop58Q6DFW4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms