Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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