Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf2Q64705 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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