Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim24Q64127 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms