Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms