Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms