Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Sin3bQ62141 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sin3bQ62141 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sin3bQ62141 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sin3bQ62141 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sin3bQ62141 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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