Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 344.1 ms