Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Traf3Q60803 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Traf3Q60803 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Traf3Q60803 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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Traf3Q60803 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Traf3Q60803 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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