Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms