Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf123Q5XPI3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf123Q5XPI3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rnf123Q5XPI3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rnf123Q5XPI3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rnf123Q5XPI3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms