Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms