Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh2Q5SW75 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms