Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Spire1Q52KF3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Spire1Q52KF3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Spire1Q52KF3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Spire1Q52KF3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spire1Q52KF3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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