Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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