Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms