Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms