Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms