Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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