Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms