Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms