Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf180Q3U827 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf180Q3U827 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf180Q3U827 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rnf180Q3U827 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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