Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms