Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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