Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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