Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms